Stasiun yang berdiri pada 1887 ini terbilang unik karena gedung stasiun terletak di tengah-tengah sisi peron dan jalur kereta api. Konsep ini dikenal dengan nama Stasiun Dua Sisi. Adapun bagian utama Stasiun Tugu menghadap ke arah timur, tepatnya ke Jalan Margo Utomo, yang merupakan poros kota Yogyakarta.
Dari data yang tersedia, tercatat ada 12 kereta api yang rutenya dialihkan, termasuk KA Kamandaka, Sawunggalih, Ranggajati, Argo Semeru, Fajar Utama Yogya, Bengawan, dan lainnya. KA 155 Kamandaka relasi Purwokerto-Semarang Tawang, KA 147 Sawunggalih relasi Kutoarjo-Pasar Senen, KA 116 Ranggajati relasi Cirebon-Jember, KA 18 Argo Semeru relasi
Jadwal kereta api Stasiun Purwokerto telah update 2022 sesuai dengan Grafik Perjalanan Kereta Api (Gapeka) 2021. Stasiun Purwokerto (PWT) adalah stasiun kereta api kelas besar tipe A yang berada di Purwokerto, Jawa Tengah. Terletak di ketinggian +75 meter, Stasiun Purwokerto berada di bawah kendali dan manajemen dari PT Kereta Api Indonesia Fajar Utama Solo, Kelas Campuran . Relasi Kutoarjo (KTA) - Solo Purwosari (PWS) Jaka Tingkir, Kelas Ekonomi Plus; Bengawan, Kelas Ekonomi . Relasi Kutoarjo (KTA) - Surabaya Gubeng (SGU) Turangga, Kelas Eksekutif; Argo Wilis, Kelas Eksekutif; Bima, Kelas Eksekutif; Pasundan, Kelas Ekonomi; Jayakarta, Kelas Ekonomi Premium; Mutiara Selatan, Kelas